新《食品安全法》共154條，本次修訂對原有104條中70%的條款進行了實質性解讀，增加了近30項新制度，對近年來食品安全領域的薄弱點及空白點進行了回應。新增制度既包括食品安全風險交流制度、全程追溯制度、行刑銜接制度等基礎性制度，又包括特殊食品產品注冊(備案)制度、農業投入品安全使用制度、食品安全責任約談制度等一系列貫穿食品安全事前、事中、事后全過程的監管制度，體現出“預防為主、風險管理、全程控制、社會共治、責任治理”的新理念。
與普通食品不同，保健食品、特殊醫學用途配方食品、嬰幼兒配方食品等屬于特殊食品，也是近年來安全事故的頻發領域。新《食品安全法》在事前監督環節增加了特殊食品產品注冊(備案)制度，對上述3種特殊食品實施嚴格監管。
以保健品為例，新的法律規定，今后保健食品的原料一定要有自己的名稱，而且功效要與之結合，每個原料的功能都要寫明;標簽、說明書應與備案一致，載明適宜人群和不適宜人群，并聲明“本品不能代替藥物”，廣告也要聲明“本品不能代替藥物”。
針對近年來備受關注的劇毒農藥超標投放、網絡食品安全事件頻發、轉基因食品越來越多等現象，新法在事中監管環節增加了農業投入品安全使用制度、網絡食品交易監管制度、特殊醫學用途配方食品制度、嬰幼兒配方食品監管制度、轉基因食品標識制度、食品安全自查制度等多項新制度，這也成為本次修法的最大亮點。
目前，在食品安全監管領域我國有兩部法律，即《食品安全法》和《農產品質量安全法》，過去存在著兩法銜接問題，這次法律規定，蔬菜等食用農產品進入市場銷售后適用《食品安全法》。新法第49條規定，不得使用國家明令禁止的農業投入品，禁止將劇毒、高毒農藥用于蔬菜、瓜果、茶葉和中草藥材等農作物。這旨在從源頭加強監管，解決前一階段出現的有關食用農產品的一些問題。
在網上購物，出了事先告誰，由誰承擔第一責任，一直存在爭議。對此，新法新增了網絡食品交易監管制度。首先，第三方平臺要承擔責任，要對入網食品經營者進行實名登記，明確其食品安全管理責任，需要行政許可的還應審查許可證。
除審查外，第三方平臺要進行監督管理，發現入網食品經營者有違法行為的應及時制止和報告，發現嚴重違法的應當停止交易服務。如果第三方平臺沒有進行實名登記，也沒有進行許可審查，出了事又沒報告，沒停止交易平臺服務，監管部門除給經營者罰款、停產停業吊銷許可證以外，使消費者合法利益受到損害的，第三方平臺要跟食品經營者承擔連帶責任。
在事后監管環節，新法增加了食品安全責任約談制度、責任連帶制度、首負責任制度、信用獎懲制度等。新法強化了地方政府的食品安全責任，企業承擔第一責任，地方政府要負總責。地方政府對本轄區食品安全監督管理要負責，統一領導組織協調本區食品安全監督管理工作以及食品安全突發事故，特別強調地方政府要加強食品安全監管能力建設，完善評議考核，實行責任約談。
這次修訂增加了兩條，一是，如果監管部門未及時發現食品安全系統性風險，未及時消除監管領域食品安全隱患，本級政府可以對監管部門的主要負責人進行約談;另一個是，地方政府未履行食品安全職責，未及時消除區域性食品安全的，上級政府可以對下級政府進行約談。
